В течение трех месяцев со дня, когда компании стало известно о нарушении ее прав и законных интересов (этот процессуальный срок установлен п. 4 ст. 198 АПК РФ).
На практике это означает, что срок обжалования налоговых решений формально начинает течь с момента их получения компанией, хотя для устранения риска пропуска указанного процессуального срока лучше обращаться в суд не позднее 3-х месяцев с даты вынесения решения ИФНС РФ.